Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms