Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE3A1L190 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms