Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CCPG1-201ENST00000310958 6822 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.834e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 CCPG1-204ENST00000563171 790 ntTSL 58.15□□□□□ -1.14e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 CCPG1-213ENST00000570272 570 ntTSL 47.55□□□□□ -1.24e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 CCPG1-211ENST00000568808 2866 ntTSL 1 (best)6.49□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.474e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.984e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 LONP1-205ENST00000587365 641 ntTSL 525.4■■□□□ 1.669e-7■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 RBM25-207ENST00000528081 3008 ntTSL 26.58□□□□□ -1.368e-9■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 ACTB-213ENST00000493945 1236 ntTSL 515.93■□□□□ 0.142e-17■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 NELFCD-205ENST00000477741 2070 ntTSL 1 (best)15.57■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 NELFCD-204ENST00000474543 2047 ntTSL 515.44■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 LINC01029-203ENST00000582805 788 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 SREK1-208ENST00000520580 2369 ntTSL 25.27□□□□□ -1.579e-7■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 COPG1-205ENST00000509889 599 ntTSL 511.37□□□□□ -0.593e-12■■■■■ 38.7
UTP3Q9NQZ2 HYOU1-215ENST00000543287 2464 ntTSL 218.8■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 38.6
UTP3Q9NQZ2 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)17.02■□□□□ 0.328e-7■■■■■ 38.6
UTP3Q9NQZ2 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 38.6
UTP3Q9NQZ2 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 38.6
UTP3Q9NQZ2 RBM25-212ENST00000532683 6848 ntTSL 1 (best)6.9□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 38.6
UTP3Q9NQZ2 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 214.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 38.6
UTP3Q9NQZ2 BMP2K-203ENST00000502613 6902 ntTSL 1 (best)6.25□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 38.6
UTP3Q9NQZ2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 38.6
UTP3Q9NQZ2 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ESYT1-204ENST00000548142 563 ntTSL 312.43□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ESYT1-207ENST00000550878 646 ntTSL 512.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ESYT1-209ENST00000551112 548 ntTSL 37.85□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ILF3-222ENST00000592763 3866 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-219ENST00000481456 5158 ntTSL 212.74□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-210ENST00000431908 914 ntTSL 512.56□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-220ENST00000482195 1232 ntTSL 210.88□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-207ENST00000427214 1005 ntTSL 57.11□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)21.91■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MVD-209ENST00000565149 2352 ntTSL 1 (best)20.58■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.951e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 STUB1-211ENST00000569248 1853 ntTSL 531.74■■■□□ 2.671e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.381e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.191e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.181e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.161e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.131e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.091e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.081e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MISP3-204ENST00000591982 2187 nt27.86■■■□□ 2.051e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.971e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ARID4A-205ENST00000424658 582 ntTSL 226.34■■□□□ 1.811e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.691e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.671e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.671e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MORF4L1-204ENST00000557961 591 ntTSL 225.24■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.551e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MISP3-203ENST00000590772 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 224.71■■□□□ 1.551e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-217ENST00000503420 580 ntTSL 423.47■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.331e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 KLC1-226ENST00000557686 535 ntTSL 322.98■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ARID4A-207ENST00000431612 697 ntTSL 1 (best)22.93■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DYRK2-206ENST00000543747 568 ntTSL 422.87■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CYHR1-207ENST00000528558 907 ntTSL 222.85■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.251e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 EIF6-207ENST00000456600 551 ntTSL 322.78■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 TCIRG1-203ENST00000524870 830 ntTSL 1 (best)22.71■■□□□ 1.234e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CMTR1-202ENST00000455891 1280 ntTSL 222.39■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-208ENST00000595800 1974 ntTSL 222.32■■□□□ 1.161e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MIEN1-202ENST00000469568 825 ntTSL 222.07■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MIEN1-204ENST00000498164 925 ntTSL 222.07■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-213ENST00000530391 648 ntTSL 321.88■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-209ENST00000455279 676 ntTSL 421.77■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.051e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-224ENST00000507829 589 ntTSL 421.57■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN2-212ENST00000540936 579 ntTSL 421.32■■□□□ 11e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 ARID4A-208ENST00000445108 965 ntTSL 321.31■■□□□ 11e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.991e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 RGS14-205ENST00000503110 587 ntTSL 520.98■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CMTR1-204ENST00000471097 457 ntTSL 320.95■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 WASHC5-206ENST00000523297 859 ntTSL 320.95■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-204ENST00000426967 838 ntTSL 220.72■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-218ENST00000503934 560 ntTSL 520.72■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 GABBR1-208ENST00000472823 4286 ntTSL 520.66■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-230ENST00000513222 511 ntTSL 420.54■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 PAIP2-206ENST00000510409 815 ntTSL 220.45■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 MIEN1-206ENST00000582963 1999 nt20.21■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 38.5
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4403.6 ms