Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 DMTF1-215ENST00000446796 610 ntTSL 53.27□□□□□ -1.894e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ITGB5-208ENST00000483168 576 ntTSL 414.5□□□□□ -0.094e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ITGB5-204ENST00000465464 1164 ntTSL 511.69□□□□□ -0.544e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ITGB5-212ENST00000608657 825 ntTSL 38.72□□□□□ -1.014e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 TF-209ENST00000475382 586 ntTSL 49.18□□□□□ -0.949e-11■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 TF-214ENST00000498622 719 ntTSL 27.52□□□□□ -1.219e-11■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 TF-208ENST00000474287 645 ntTSL 216.67■□□□□ 0.269e-9■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 53.27□□□□□ -1.892e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 TF-202ENST00000414694 546 ntTSL 418.27■□□□□ 0.529e-9■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 TF-203ENST00000460531 577 ntTSL 418.27■□□□□ 0.529e-9■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 TF-206ENST00000466911 526 ntTSL 415.09■□□□□ 0.019e-9■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.399e-9■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 FNBP4-213ENST00000534003 2515 ntTSL 517.89■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.41e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 FNBP4-207ENST00000528388 814 ntTSL 23.88□□□□□ -1.791e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CSNK1D-220ENST00000581737 631 ntTSL 213.31□□□□□ -0.286e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CSNK1D-224ENST00000584672 401 ntTSL 312.89□□□□□ -0.356e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 SEPT5-215ENST00000490204 774 ntTSL 520.11■□□□□ 0.812e-18■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 FAR1-203ENST00000527202 603 ntTSL 25.65□□□□□ -1.59e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CCT6A-209ENST00000494736 411 ntTSL 25.64□□□□□ -1.514e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CCL20-204ENST00000489160 673 ntTSL 34.33□□□□□ -1.724e-24■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 NDRG1-205ENST00000517745 391 ntTSL 313.29□□□□□ -0.286e-11■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.483e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.453e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.441e-14■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZNF212-202ENST00000462724 860 ntTSL 523.3■■□□□ 1.323e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 SDF4-206ENST00000478938 2591 ntTSL 222.29■■□□□ 1.163e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.043e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 SRCAP-203ENST00000411466 836 ntTSL 321.35■■□□□ 1.017e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 BMP2K-202ENST00000389010 2741 ntTSL 1 (best)21.27■□□□□ 0.991e-14■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HUWE1-205ENST00000446750 872 ntTSL 521.06■□□□□ 0.963e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.957e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 KIF13A-211ENST00000507576 529 ntTSL 320.55■□□□□ 0.883e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.882e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 REV1-203ENST00000413697 4727 ntTSL 220.12■□□□□ 0.812e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZNF212-204ENST00000486371 637 ntTSL 319.89■□□□□ 0.773e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.773e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 SYF2-204ENST00000476231 1962 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.723e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.691e-14■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.617e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.617e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.617e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 SYF2-203ENST00000474160 438 ntTSL 218.08■□□□□ 0.483e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 TRMT112-204ENST00000537918 559 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.473e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 GDF15-203ENST00000595973 890 ntTSL 517.62■□□□□ 0.413e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 RHBDF1-209ENST00000486045 914 ntTSL 216.99■□□□□ 0.313e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.261e-14■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 SDF4-207ENST00000494748 3516 ntTSL 216.23■□□□□ 0.193e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 PIGS-205ENST00000484580 919 ntTSL 314.87□□□□□ -0.033e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ADIPOR1-204ENST00000426229 879 ntTSL 214.53□□□□□ -0.083e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-209ENST00000592167 461 ntTSL 413.83□□□□□ -0.27e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ADIPOR1-203ENST00000417068 1058 ntTSL 313.7□□□□□ -0.223e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DIAPH1-210ENST00000494967 629 ntTSL 213.68□□□□□ -0.227e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.263e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 PDS5A-205ENST00000506262 559 ntTSL 312.86□□□□□ -0.353e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-214ENST00000614600 2285 ntTSL 512.31□□□□□ -0.447e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-211ENST00000470908 884 ntTSL 512.24□□□□□ -0.453e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 NBEAL2-202ENST00000423436 765 ntTSL 311.93□□□□□ -0.53e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 RHBDF1-211ENST00000493647 935 ntTSL 311.93□□□□□ -0.53e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-220ENST00000621668 2055 ntTSL 511.73□□□□□ -0.537e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DIAPH1-209ENST00000491754 557 ntTSL 411.55□□□□□ -0.567e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP19-SLIT1-202ENST00000479633 1876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.627e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-205ENST00000590432 554 ntTSL 411.12□□□□□ -0.637e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ARHGEF2-212ENST00000474428 742 ntTSL 310.96□□□□□ -0.653e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ARHGEF2-210ENST00000470975 638 ntTSL 210.78□□□□□ -0.683e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.697e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-212ENST00000612035 2161 ntTSL 510.63□□□□□ -0.717e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.737e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-209ENST00000463049 6102 ntTSL 510.22□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-206ENST00000444261 513 ntTSL 210.08□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 PIGS-211ENST00000582615 699 ntTSL 210.03□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.867e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CTPS1-210ENST00000486889 568 ntTSL 29.54□□□□□ -0.883e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 59.2□□□□□ -0.947e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.957e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP19-206ENST00000492211 5525 ntTSL 28.84□□□□□ -0.997e-10■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-216ENST00000616784 2542 ntTSL 58.65□□□□□ -1.027e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.077e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CTPS1-203ENST00000463285 739 ntTSL 38.28□□□□□ -1.083e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.097e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-206ENST00000590538 568 ntTSL 48.11□□□□□ -1.117e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-208ENST00000591610 559 ntTSL 48.11□□□□□ -1.117e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-212ENST00000471783 552 ntTSL 38.09□□□□□ -1.113e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-202ENST00000588093 334 ntTSL 38.09□□□□□ -1.117e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.127e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.163e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ZC3H14-203ENST00000318308 1384 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.163e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.193e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.193e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CTPS1-209ENST00000480420 750 ntTSL 37.56□□□□□ -1.23e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.227e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.233e-6■□□□□ 10.7
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