Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 HNF1A-204ENST00000535955 434 ntTSL 1 (best)11.04□□□□□ -0.641e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 RTKN-209ENST00000484453 820 ntTSL 1 (best)21.38■■□□□ 1.017e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.992e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 GNB1L-204ENST00000453108 702 ntTSL 320.26■□□□□ 0.832e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 RTL10-204ENST00000416337 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.47■□□□□ 0.392e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 GNB1L-206ENST00000481086 854 ntTSL 317.47■□□□□ 0.392e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 GNB1L-205ENST00000460402 1197 ntTSL 317.18■□□□□ 0.342e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 RTL10-205ENST00000484072 1385 ntTSL 212.91□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 BUB3-204ENST00000407911 895 ntTSL 1 (best)12.25□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 BTNL9-208ENST00000512570 885 ntTSL 514.91□□□□□ -0.024e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.492e-25■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.442e-25■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.182e-25■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 INSIG1-206ENST00000476756 1320 ntTSL 210.9□□□□□ -0.662e-25■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SCFD1-212ENST00000554486 819 ntTSL 36.21□□□□□ -1.422e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 INSIG1-205ENST00000468307 852 ntTSL 54.66□□□□□ -1.662e-25■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.61e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.191e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SPG21-205ENST00000558339 582 ntTSL 420.41■□□□□ 0.861e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SPG21-211ENST00000560564 607 ntTSL 415.2■□□□□ 0.021e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SPG21-213ENST00000561078 1520 ntTSL 514.99□□□□□ -0.011e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SPG21-210ENST00000559677 553 ntTSL 38.51□□□□□ -1.051e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 YARS-204ENST00000470377 782 ntTSL 37.25□□□□□ -1.254e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 REPIN1-216ENST00000518462 621 ntTSL 417.37■□□□□ 0.375e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 IGF2BP2-211ENST00000496495 472 ntTSL 24.33□□□□□ -1.722e-9■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 LPCAT1-205ENST00000513757 547 ntTSL 49.02□□□□□ -0.978e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 FMO5-205ENST00000527849 2410 ntTSL 517.79■□□□□ 0.445e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 PGGHG-208ENST00000529087 745 ntTSL 217.51■□□□□ 0.395e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 TNS2-215ENST00000551583 525 ntTSL 217.16■□□□□ 0.345e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.245e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 PGGHG-207ENST00000482937 734 ntTSL 516.33■□□□□ 0.25e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.085e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SRC-210ENST00000493775 559 ntTSL 414.46□□□□□ -0.095e-21■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 NELFE-207ENST00000454913 914 ntTSL 514.22□□□□□ -0.135e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 NELFE-204ENST00000436289 906 ntTSL 513.79□□□□□ -0.25e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 CDK18-207ENST00000468954 468 ntTSL 212.92□□□□□ -0.342e-8■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 FMO5-209ENST00000619062 1842 ntTSL 211.82□□□□□ -0.525e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.055e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.145e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 FMO5-206ENST00000533174 671 ntTSL 45.94□□□□□ -1.465e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 UNKL-214ENST00000515195 481 ntTSL 414.97□□□□□ -0.011e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 ELAC2-219ENST00000609101 866 ntTSL 512.98□□□□□ -0.331e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 ELAC2-204ENST00000446899 858 ntTSL 512.42□□□□□ -0.421e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 ELAC2-220ENST00000609345 849 ntTSL 39.51□□□□□ -0.891e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 MPP1-218ENST00000494170 969 ntTSL 313.97□□□□□ -0.177e-14■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 MPP1-210ENST00000462825 587 ntTSL 413.5□□□□□ -0.257e-14■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 MPP1-212ENST00000475943 860 ntTSL 1 (best)13.2□□□□□ -0.37e-14■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 MPP1-209ENST00000453245 729 ntTSL 511.75□□□□□ -0.537e-14■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 MPP1-203ENST00000393529 794 ntTSL 58.07□□□□□ -1.127e-14■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.561e-21■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-21■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.878e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 PLCXD1-208ENST00000445062 555 ntTSL 419.98■□□□□ 0.793e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 PLCXD1-205ENST00000429181 469 ntTSL 414.2□□□□□ -0.143e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 ENTPD6-215ENST00000471478 991 ntTSL 518.74■□□□□ 0.592e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ENTPD6-213ENST00000447877 932 ntTSL 517.9■□□□□ 0.462e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 ENTPD6-204ENST00000376666 2100 ntTSL 515.92■□□□□ 0.142e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 411.46□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 CSNK1D-210ENST00000579308 598 ntTSL 29.87□□□□□ -0.832e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 RERE-214ENST00000488215 962 ntTSL 39.25□□□□□ -0.932e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.792e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 413.79□□□□□ -0.21e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 210.62□□□□□ -0.711e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 32.62□□□□□ -1.991e-7■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.364e-9■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.314e-9■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.064e-9■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MPP1-208ENST00000439370 2066 ntTSL 512.5□□□□□ -0.414e-9■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 MPP1-215ENST00000488754 553 ntTSL 38.66□□□□□ -1.024e-13■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.436e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HMGA2-207ENST00000537275 1508 ntTSL 1 (best)23.99■■□□□ 1.436e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HMGA2-208ENST00000537429 1527 ntTSL 1 (best)23.99■■□□□ 1.436e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.346e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.236e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.116e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.016e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HMGA2-211ENST00000545998 1584 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.786e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.246e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.096e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.265e-20■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.053e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)19.69■□□□□ 0.743e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.523e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.243e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 PCSK6-213ENST00000560902 501 ntTSL 47.97□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DMTF1-237ENST00000584457 569 ntTSL 414.14□□□□□ -0.154e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DMTF1-205ENST00000414630 627 ntTSL 58.24□□□□□ -1.094e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DMTF1-217ENST00000448598 572 ntTSL 46.51□□□□□ -1.374e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DMTF1-219ENST00000453049 585 ntTSL 46.46□□□□□ -1.384e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DMTF1-211ENST00000430405 637 ntTSL 55.66□□□□□ -1.54e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DMTF1-206ENST00000420131 568 ntTSL 45.08□□□□□ -1.64e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DMTF1-210ENST00000428819 533 ntTSL 45.08□□□□□ -1.64e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DMTF1-218ENST00000449088 783 ntTSL 55.08□□□□□ -1.64e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DMTF1-207ENST00000423590 545 ntTSL 54.95□□□□□ -1.624e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2Q15029 DMTF1-212ENST00000432366 557 ntTSL 54.65□□□□□ -1.674e-8■□□□□ 10.7
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