Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC4Q9Y696 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms