Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED7Q9Y3B3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms