Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA3Q9XRX5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms