Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF3Q9ULD4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms