Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGXB4Q9UGU5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms