Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCF2Q9UG63 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms