Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLKQ9UBT6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms