Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TFIP11Q9UBB9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFIP11Q9UBB9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms