Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4Q9P0V3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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SH3BP4Q9P0V3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4Q9P0V3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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