Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.422e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 53.09□□□□□ -1.922e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 52.7□□□□□ -1.982e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-238ENST00000521116 806 ntTSL 425.67■■□□□ 1.73e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-228ENST00000515714 690 ntTSL 422.96■■□□□ 1.273e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-245ENST00000523137 1563 ntTSL 422.5■■□□□ 1.193e-7■■□□□ 11.5
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AATFQ9NY61 HNRNPH1-212ENST00000505087 592 ntTSL 321.58■■□□□ 1.053e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-208ENST00000503664 569 ntTSL 420.27■□□□□ 0.843e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-225ENST00000515158 850 ntTSL 419.21■□□□□ 0.673e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-213ENST00000505811 1155 ntTSL 518.31■□□□□ 0.523e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-220ENST00000513225 805 ntTSL 417.26■□□□□ 0.353e-7■■□□□ 11.5
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AATFQ9NY61 HNRNPH1-209ENST00000504348 594 ntTSL 416.48■□□□□ 0.233e-7■■□□□ 11.5
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AATFQ9NY61 HNRNPH1-217ENST00000510431 620 ntTSL 216.27■□□□□ 0.23e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-234ENST00000519707 582 ntTSL 216.27■□□□□ 0.23e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-233ENST00000519455 451 ntTSL 416.23■□□□□ 0.193e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-214ENST00000506721 602 ntTSL 516.14■□□□□ 0.173e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 216.14■□□□□ 0.173e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.123e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-222ENST00000513972 761 ntTSL 215.49■□□□□ 0.073e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-232ENST00000519056 530 ntTSL 414.77□□□□□ -0.053e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.093e-7■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 HNRNPH1-219ENST00000512273 501 ntTSL 410.44□□□□□ -0.743e-7■■□□□ 11.5
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AATFQ9NY61 CTBP2-206ENST00000460976 603 ntTSL 532.26■■■□□ 2.754e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 LONP1-204ENST00000586617 471 ntTSL 531.19■■■□□ 2.584e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 STIP1-208ENST00000540501 880 ntTSL 330.87■■■□□ 2.534e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 PIK3CB-202ENST00000461451 667 ntTSL 229.26■■■□□ 2.274e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 LONP1-205ENST00000587365 641 ntTSL 529.21■■■□□ 2.274e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 INPPL1-211ENST00000541544 530 ntTSL 228.57■■■□□ 2.164e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.064e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 PIK3CB-210ENST00000483968 721 ntTSL 327.58■■■□□ 2.014e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 525.61■■□□□ 1.694e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 CTBP2-208ENST00000476817 705 ntTSL 325.55■■□□□ 1.684e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.364e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.334e-6■■□□□ 11.5
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AATFQ9NY61 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.214e-6■■□□□ 11.5
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AATFQ9NY61 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.074e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.014e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.014e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.984e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.974e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.944e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 220.84■□□□□ 0.934e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 LONP1-211ENST00000590558 2884 ntTSL 520.69■□□□□ 0.94e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.694e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 DNAJB6-208ENST00000441561 1022 ntTSL 519.31■□□□□ 0.684e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 IGF2BP3-203ENST00000465058 534 ntTSL 419.3■□□□□ 0.684e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 IGF2BP3-211ENST00000479504 559 ntTSL 419.3■□□□□ 0.684e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 PIK3CB-204ENST00000462898 4747 ntTSL 519.23■□□□□ 0.674e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.524e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 IGF2BP3-204ENST00000466809 588 ntTSL 518.19■□□□□ 0.54e-6■■□□□ 11.5
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AATFQ9NY61 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.334e-6■■□□□ 11.5
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AATFQ9NY61 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.234e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 DNAJB6-214ENST00000486083 699 ntTSL 516.16■□□□□ 0.184e-6■■□□□ 11.5
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AATFQ9NY61 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.154e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.154e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 DAZAP1-208ENST00000589874 3642 nt15.85■□□□□ 0.134e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.084e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 STIP1-204ENST00000536973 738 ntTSL 515.36■□□□□ 0.054e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)15.21■□□□□ 0.034e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 DAZAP1-203ENST00000585485 3943 ntTSL 214.51□□□□□ -0.094e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 RREB1-208ENST00000483150 2833 ntTSL 1 (best)14.33□□□□□ -0.124e-6■■□□□ 11.5
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AATFQ9NY61 DNAJB6-203ENST00000417758 852 ntTSL 513.49□□□□□ -0.254e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 CTBP2-212ENST00000530884 578 ntTSL 312.95□□□□□ -0.344e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 STIP1-211ENST00000543847 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.414e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 DNAJB6-217ENST00000488001 551 ntTSL 410.93□□□□□ -0.664e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 IGF2BP3-208ENST00000469723 556 ntTSL 59.95□□□□□ -0.824e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 RREB1-207ENST00000475946 9067 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.954e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.054e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 MKNK2-210ENST00000589534 454 ntTSL 232.74■■■□□ 2.835e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 MKNK2-209ENST00000589509 352 ntTSL 514.59□□□□□ -0.075e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.09□□□□□ -1.751e-323■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 RNF19A-211ENST00000523167 792 ntTSL 430.23■■■□□ 2.432e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.692e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 RNF19A-204ENST00000519342 562 ntTSL 418.71■□□□□ 0.592e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 RNF19A-209ENST00000522182 544 ntTSL 410.27□□□□□ -0.772e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 RNF19A-210ENST00000522369 612 ntTSL 410.27□□□□□ -0.772e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 RNF19A-213ENST00000523481 547 ntTSL 49.47□□□□□ -0.892e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 RNF19A-206ENST00000519527 817 ntTSL 33.77□□□□□ -1.812e-7■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.251e-6■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 CHTF18-216ENST00000565787 607 ntTSL 528.87■■■□□ 2.212e-6■■□□□ 11.4
AATFQ9NY61 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)27.91■■■□□ 2.062e-6■■□□□ 11.4
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