Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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