Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHBDL2Q9NX52 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms