Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB4Q9NTQ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB4Q9NTQ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms