Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMYD2Q9NRG4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms