Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SH2B1Q9NRF2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms