Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRPM3Q9HCF6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPM3Q9HCF6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms