Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A3Q9HAS3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms