Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8Y1

VRTN, Vertnin, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRTNQ9H8Y1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VRTNQ9H8Y1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VRTNQ9H8Y1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms