Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN2Q9H4D0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLSTN2Q9H4D0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms