Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms