Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RNF17Q9BXT8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RNF17Q9BXT8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms