Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms