Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHCHD7Q9BUK0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHCHD7Q9BUK0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CHCHD7Q9BUK0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHCHD7Q9BUK0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHCHD7Q9BUK0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHCHD7Q9BUK0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHCHD7Q9BUK0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHCHD7Q9BUK0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD7Q9BUK0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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