Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms