Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMSS1Q9BQ75 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMSS1Q9BQ75 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms