Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP19Q99542 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP19Q99542 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms