Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT12Q99456 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms