Protein–RNA interactions for Protein: Q96M34

C3orf30, Uncharacterized protein C3orf30, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf30Q96M34 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C3orf30Q96M34 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C3orf30Q96M34 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C3orf30Q96M34 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C3orf30Q96M34 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf30Q96M34 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms