Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT6

C1orf74, UPF0739 protein C1orf74, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf74Q96LT6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1orf74Q96LT6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf74Q96LT6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms