Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms