Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNIP3Q96KP6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms