Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5RAP3Q96JB5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms