Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED3Q96IU2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED3Q96IU2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED3Q96IU2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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