Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP36Q96G28 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP36Q96G28 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms