Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms