Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms