Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCE1Q969G3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms