Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN4Q92575 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms