Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3CQ92520 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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