Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D1Q8WV19 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms