Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG1Q8WTW3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG1Q8WTW3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms