Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEST2Q8NFU1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms