Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APCDD1LQ8NCL9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APCDD1LQ8NCL9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms