Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
C17orf53Q8N3J3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf53Q8N3J3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms