Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1F7

NUP93, Nuclear pore complex protein Nup93, humanhuman

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP93Q8N1F7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP93Q8N1F7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP93Q8N1F7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms